動かし方

ターミナルにて
g++ -o hello hello.cxxでコンパイル
./helloで実行

ファイル出力

#include <fstream >
char fout[20]="hello.txt"
ofstrem ofs(fout);
ofs << i << ",";

ファイルから代入する

実行時に./hello < hello.txt

ファイルへ出力する

実行時に./hello > hello.txt

プログラム1の出力をプログラム2に入れてファイルへ出力する

./hello1 | ./hello2 > hello2.txt

検索方法

C言語のソースをネットで探すにはコツがあって、ソースに含まれそうなキーワードを追加すると、比較的簡単にみつけれます。
今回だと「DLAシミュレーション stdio.h 結晶」で検索するとすぐみつかりました。